本校有多所姊妹校，學生可透過交換生、移地教學、學術交流等多種方式，認識其他國家，擴大國際視野。本系正努力推動的有：

1.日本琉球大學：理學院與日本琉球大學長期交流，除了移地教學、聯合課程考察、學術合作、共同舉辦研討會外，也鼓勵學生至該校擔任交換生，目前正積極推動雙聯學制。

2.美國國家海洋暨大氣總署（NOAA）：本系與NOAA人員長期交流，除了參與美國國家氣象局舉辦之工作研討會外，為促進台美科學研究，NOAA亦定期提供員額，讓本系師生參訪NOAA所屬研究單位。